Este estudo teve como objetivo analisar a aplicação do Mapeamento do Fluxo de Valor (MFV) no fluxo de gestão de convênios em uma Instituição Federal de Ensino Superior (IFES). Por meio de um estudo de caso de natureza aplicada e abordagem quantitativa, examinou-se a tramitação de convênios oriundos de Termos de Execução Descentralizada (TED) e convênios para projetos de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação (PD&I). O mapeamento indicou que a otimização dos fluxos de TED pode reduzir o Lead Time em 34,88%. Já nos processos de PD&I, a inserção de uma etapa obrigatória previamente omitida aumentou o Lead Time em 34,17%, assegurando, no entanto, a conformidade legal e a agregação de valor. Os resultados demonstram a aderência do MFV à administração pública, evidenciando que as práticas Lean são ferramentas valiosas não apenas na indústria, mas também na otimização e modernização dos serviços públicos.